慢性病毒性肝炎是我国常见的慢性传染病之一，尤其是慢性乙型及丙型肝炎，严重危害人民健康。为进一步规范慢性病毒性肝炎的预防、诊断和治疗，按照循证医学的原则，医院制订了《慢性病毒性肝炎诊疗规范》，设立慢性肝病科，并作为医院重点科室。其学科带头人徐龙教授作为省肝病学会常委，江西省肝病学术和技术带头人培养对象，尤其擅长慢性病毒性肝炎的基础与临床研究。
医院对慢性病毒性肝炎的治疗目标是：
最大限度地长期抑制或清除乙肝病毒、丙肝病毒、丁肝病毒，减轻肝细胞炎症坏死及其所致的肝纤维化，延缓病情进展，减少肝硬化、原发性肝癌及其并发症的发生，从而改善生活质量等。强调慢性病毒性肝炎个体化治疗，治疗前对患者实施全面评估，包括病情、家族史、治疗史、经济情况、依从性等，治疗前后注意对患者咨询的正确、全面答复。
对慢性病毒性肝炎的治疗：
根据患者具体情况采用综合性治疗方案，包括合理的休息和营养，心理平衡，抗病毒、调节机体免疫，改善和恢复肝功能，抗纤维化等。强调对慢性病毒性肝炎抗病毒是治疗关键。抗病毒治疗药物如普通干扰素α、长效干扰素α、拉米夫定、阿德福韦酯、恩替卡韦、替比夫定及利巴韦林，使用达到国内领先水平，监测早期病毒应答水平来预测和优化及改变治疗方案，根据治疗路线图实施耐药干预前移，降低了核苷(酸)类似物耐药的发生率，提高了难治性乙型、丙型病毒性肝炎成功率。
医院针对慢性病毒性肝炎的治疗开展了光量子血氧、治疗性疫苗、树突状细胞、乙肝病毒基因分型、HBVCCCDNA、乙肝病毒家庭聚集性及干预的临床研究，其中《江西地区乙型肝炎患者乙肝病毒基因型的临床研究》获南昌市科技进步奖。
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