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我院于1997年成立人工肝治疗中心，在省内率先引进具有国际先进水平的日本KM-8800型人工肝治疗仪，随后又引进KM-8900型、德国MARS及KM-8800换代型人工肝治疗仪开展单纯血浆置换、血浆吸附、血液吸附、缓慢式部分血浆置换、缓慢持续血液滤过透析和血脂净化治疗技术。人工肝支持系统治疗重症肝炎、肝衰竭与多系统器官衰竭，使重症肝炎死亡率由80%下降到30%左右，该技术达国内领先，国际先进。人工肝支持系统还可用于治疗胆汁淤积性肝炎、家族性胆固醇增高症、淀粉变性、系统性红斑狼疮、急慢性药物中毒等。
该中心还为北京、重庆、成都、长沙等全国40多家大中城市传染病院培养人工肝技术高级人才近200人，成为全国人工肝培训中心和临床应用研究中心。
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血液净化中心率先在省内开展腹膜透析疗法、血液透析疗法治疗流行性出血热少尿期肾衰、高血容量综合症及毒物、药物中毒等治疗。随后又引进6台ZCL-282型光量子血氧治疗仪开展感染性疾病尤其是肝病的光量子血氧治疗，以改善患者的微循环，提高血氧饱和度，调整免疫，并杀灭细菌、病毒等病原微生物。该疗法填补了江西省内空白。
血液净化中心还开展腹水浓缩回输疗法治疗晚期肝硬化、难治性腹水，提高了肝硬化治疗效果，后又将单纯腹水浓缩回输改为腹水透析浓缩回输，解决了单纯腹水浓缩回输的堵管问题（堵管发生率由原来的20%降为0），减少了感染机会，为难治性腹水的治疗提供了一种有效的治疗方法。
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随着人们生活水平的提高，运动量减少、饮酒、慢性病引起的内分泌失调等多种因素的影响，脂肪肝在我国的平均发病率达到了15%，高发地区达到了20%以上，一些患者已经发展为脂肪肝性肝炎、肝纤维化、肝硬化。脂肪肝已成为我国继乙肝之后的第二大肝病，脂肪肝的治疗成了临床上棘手的问题。我院运用HD-肝病治疗仪治疗脂肪肝是将物理学与医学相结合，改变人体的局部血液、体液流速及流量，使得肝脏积存的脂肪排出，缓解症状，消除脂肪肝引起的肝脾肿大，降低血脂，最终达到治疗脂肪肝的目的。该疗法已通过国家中医药管理局鉴定，医院在治疗脂肪肝方面处于全省领先水平。
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开展肝硬化、门静脉高压、肝癌、胆结石、胆囊炎等围肝外科手术。
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中心实验室包括放免室、酶免室、PCR室、艾滋病初筛实验室。可应用酶标仪、PCR仪、r-计数仪、美国Coda酶免分析仪开展甲、乙、丙、丁、戊、庚型肝炎病毒和TTV病毒标志物测定，HBV、HCV基因分型、HBV基因变异及肝炎相关病毒检测、肝纤维四项、肿瘤项目及乙肝十项、细胞因子和性病项目检测。医院还建立了HIV初筛实验室，已通过江西省疾病预防控制中心验收。
生化科拥有全自动生化分析仪、血气分析仪和电解质分析仪等设备，可开展ALT、AST、胆固醇、甘油三脂、脂肪代谢、肾功能等项目检测。
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对ＨＢＶ感染的孕妇进行人工干预，使新生儿免受乙肝病毒感染。
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我院于1998年10月成立远程医疗会诊中心，引进国际医学互联网远程医疗会诊系统，开展肝病疑难重症患者的远程医疗会诊工作，使患者不出远门便可得到国内外顶尖肝病专家的会诊，方便了患者就医和诊治。
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医院经省卫生厅批准正式对外挂牌“江西省艾滋病治疗中心”，承担江西省艾滋病病人的治疗任务。医院培养了艾滋病专业医师和护士，并先后选派4名青年医师到北京佑安医院、上海传染病院进修学习，管理治疗了艾滋病病人，都已具备良好的临床经验。
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